『長尾山年譜』は、第１巻、第２巻、第３巻の上、第３巻の下、第４巻と区分され、全５冊からなっている。本年譜は「肥前之州、佐嘉県、河副江上、護国長尾山福満寺年譜序」より書きはじめてあり、当寺の開基の由来、各世代住持における出来事、皇室や武将との関係とその信仰状況、伽藍再建の模様、寺領及び寺有地の内容、各種の年間行事仏事法要などについて詳細に年代順にしたためてある。
本年譜には、各巻の巻末奥附に記録年号が奥書してあり、第１巻は「貞享三年九月初七夜染毫」とあるので貞享３年(1686)9月から、したためたものである。したがって、それ以前の開基より鎌倉、室町、桃山の各時代の年譜は、その当時、当寺に所蔵されていた各種旧記や文書、伝承によって記されていた各種旧記や文書、伝承によって記されたものであろう。
第２巻は、貞享３年９月に書かれたものを汚損甚だしかったために「享和元年夏五月住諦観識」として再写してある。したがって、最初に記録されてから150年後享和元年(1801)に再録されたものである。
第３巻の上は「貞享三丙寅十月二十一日書了」とあり、第３巻の下と第４巻は「貞享四年正月十三日書了」とあるので、２年にわたって記録された年譜である。